Pier Francesco Mola var født i Coldrerio ved Como-søen i 1612 som søn af arkitekten Giovanni Battista Mola, der i 1616 rejste til Rom med sin familie.

Her kom Pier Francesco i lære som maler hos Prospero Orsi og Giuseppe Cesari ("Il Cavalier d'Arpino"). Senere arbejdede han hos Francesco Albani i Bologna og var også i Venedig i en periode.

I de første år af Pier Francesco Mola's selvstændige virke arbejdede han i Lucca og i sin hjem Coldrerio, men senere drog han til Rom, hvor han derpå forblev.

I 1655 blev Mola medlem af kunstnersammenslutningen Accademia di San Luca.

Af Pier Francesco Mola's værker i Rom kender vi:

I Kirken Santa Anastasia: maleri af San Giovanni Battista.

I Kirken San Carlo al Corso: maleri af Barnabas.

Altertavle i Kirken Santi Domenico e Sisto på det tredie alter i højre side ("Cappella di San Domenico"), malet i 1648. Den forestiller "Visione di un converso domenicano" ("En Dominikaner-lægbroder's syn") og refererer til legenden om, hvorledes lægbroderen Lorenzo da Grotteria den 15.9.1530 i et syn modtog et portræt af San Domenico fra Santa Caterina d'Alessandria, Santa Maria Maddalena og Jomfru Maria, der bad ham om at anbringe det på alteret. Alteret blev betalt af de fire søstre Paola Maria, Maria Candida, Maria Agnese og Prospera Vincenza Costaguti, som bestilte det i 1624. Familiens våben sidder mellem 2 stukengle over buen i Kirkevæggen. Væggene i rummet er beklædt med marmor og loftet er bemalet med freskerne "San Domenico in gloria", i en ramme i midten, og "Miracoli del Santo" på hver side. Også disse fresker menes udført af Mola, som i denne periode (1648) arbejdede for Costaguti-familien i Palazzo Mattei.

I Kirken Gesù: San Paolo.

I Kirken San Marco: fresko med to martyrer (1653-1657) samt altertavle med maleri af San Michele (1655).

I Palazzo del Quirinale, Galleria di Alessandro VII: fresko med San Giuseppe (1657).

Mange malerier af Mola findes også i Roms kunstmuseer, for eksempel:

I Accademia di San Luca: en gammel kvinde, der spinder.

I Galleria Barberini: en gammel kvinde og San Gerolamo.

I Galleria Colonna: Hagar og englen, Rebekka ved brønden.

I Galleria Spada: Bacchus.

Pier Francesco Mola døde i Rom i 1666.