Kirken Santa Caterina dei Funari, der rejser sig på østsiden af Via Michelangelo Caetani med hovedfacade og indgang fra Via dei Funari, står på det sted, hvor der fra før 1000-tallet lå et stort Klosterkompleks med tilhørende kirke kaldet Santa Maria dominae Rosae eller Santa Maria in castro aureo.

Den gamle Kirke lå dog lidt anderledes og havde indgang fra nutidens Via Caetani. Nutidens Kirke blev bygget i perioden 1560-1564 af arkitekten Guido Guidetti med Kardinal Cesi som sponsor. Klokketårnet til højre er imidlertid bygget over et tårn fra 1400-tallet.

I Kirken findes en række smukke malerier af det 16.århundredes store malere.

Nord for Kirken, langs Via Caetani og op til Via delle Botteghe Oscure lå det gamle Kloster, som fra 1500-tallet også husede et stort hjem for fattige unge kvinder, styret af organisationen Compagnia delle Vergini Miserrabili Pericolanti, der var blevet grundlagt af Sant'Ignazio di Loyola i 1534, da han fik Komplekset overladt af Pave Paul III.

På tekstbåndet, der løber over Kirkens facade, har arkitekten og bygmesteren efterladt deres navnetræk: "Guideto de Guideti architector" og "Bartolomeo da Casale de Monfera(to) mastro muratori".

Den tidligere Kirke var bygget på ruinerne af det store antikke anlæg kaldet Crypta Balbi, som lå i tilknytning til det mod vest liggende Theatrum Balbi. Middelalderkirken Santa Caterina Dominae Rosae fik i 1500-tallet fik tilbygget et Kloster, hvortil mange af de bygninger, man nu kan se ud til Via delle Botteghe Oscure og Via Caetani, hørte. På et tidspunkt blev Klosteret nedlagt og i 1981 købte Den Italienske Stat bygningerne. Trods økonomiske problemer i starten, tog udgravningerne efterhånden fart, og i år 2000 kunne Museo della Crypta Balbi åbne. Museets officielle navn er: Museo Nazionale Romano - Crypta Balbi.