Denne lille kirke nævnes i teksten "Mirabilia Urbis" fra det 12.århundrede og der er delte meninger om den. Huelsen mener, at det måske er Kirken San Lorenzo in Fonte, som her er benævnt således, mens Liliana Barroero mener, at det drejer sig om en selvstændig lille kirke, som har ligget i nærheden af San Lorenzo in Fonte ved Via Urbana og derfor i nærheden af den brønd eller kilde (fonte/fontana), som findes i denne kirke og som ifølge legenden udsprang, da San Lorenzo ville døbe sin fangevogter Sant'Ippolito. I virkeligheden menes det at dreje sig om en rest fra et antikt badeanlæg.

Det er muligt, at det var en tidligere hedensk helligdom, Templum Fauni, viet til Guden Lupercus eller Guden Faunus, som senere var blevet omdannet til kirke og viet til Jomfru Maria. Man har fundet rester fra dette tempel i det 17.århundrede, da Via Urbana blev sat i stand, og det blev ved den lejlighed tegnet af Grimaldo. Ved samme lejlighed forsvandt også de eventuelle rester af Santa Maria in Fontana.

Litteratur om Santa Maria in Fontana:
La Grande Guida dei Rioni di Roma. 2.edizione. Newton Compton editori, 2001.
- side 87.
Guide Rionali di Roma. Fratelli Palombi Editori, 1973- .
- Rione I, Monti, del 3: side 60ff.
Lanciani, Rodolfo: Forma Urbis Romae. Edizione Quasar, 1991.
-kort nr.22-23.
Lombardi, Ferruccio: Roma - le chiese scomparse. Fratelli Palombi Editori, 2.ed. 1998.
- side 76.