Man kender ikke Federico Zuccari's nøjagtige fødselsår, som angives enten som 1540, 1542 eller 1543, men han blev sandsynligvis født i byen Sant'Angelo in Vado ved Urbino, hvor hans fader, maleren Ottaviano Zuccari boede med sin familie, hustruen Antonia Negri og sønnen Taddeo, der var født i 1529.

I 1550 flyttede familien til Rom og Federico blev her oplært af sin broder Taddeo, for hvem han også senere arbejdede i perioder. I 1573 blev han medlem af Congregazione dei Virtuosi al Pantheon. Federico Zuccari rejste og arbejdede også meget i andre byer i Italien samt i udlandet.

Fra omkring 1572 havde Zuccari som hjælp i sit værksted maleren Raffaello Motta, kaldet Raffaellino da Reggio, der deltog i arbejdet i Kirken Santa Caterina dei Funari, i det 3.kapel i højre side, Cappella della Vetera, hvor denne selstændigt udførte: fresker af englebørn og helgener på sidevæggene og muligvis var medarbejder på Federico Zuccari's fresker af scener fra Santa Caterina's liv sammesteds.

Af Federico Zuccari's værker i Rom kender vi:

1556: medarbejder på broderens værk i Casa Mattei.

Facademaleri på Casa Tizio da Spoleto på hjørnet af Via della Palombella og Piazza di Sant'Eustachio overfor Kirken Sant'Eustachio, muligvis udført sammen med sin broder. Malerierne er restaurerede og flere kan tydeligt aflæses idag. (Se fotos her)

1561 og 1563 arbejder i Vatikanet: 16 fresker i den store sal i Palazzo Belvedere udført sammen med F. Barocci.

1561/1562: maleri i Casino di Pio IV.

I 1566 overtog han efter broderen Taddeo's død dennes arbejde i Kirken Gesù samt fresker i Sala Regia i Vatikanet.

1573: maleri i Oratoriet i Kirken Santa Lucia del Gonfalone.

I 1580 fuldendte Zuccari den af Michelangelo påbegyndte udsmykning af Cappella Paolina i Vatikanet. Foretog yderligere arbejder i kapellet i 1583-1584.

I Kirken Santa Pudenziana: tegning til mosaikkerne udført af Paolo Rossetti i Cappella Caetani (ca. 1588).

På et tidspunkt efter 1590 malede Federico Zuccari altertavlen med "Cristo con la Croce incontra la Veronica" ("Kristus med Korset møder Veronica") til Cappella Olgiati i Kirken Santa Prassede.

I 1593 kunne Federico Zuccari indvi sit nybyggede og freskoudsmykkede hus i Via Gregoriana.

I 1593 holdt Federico Zuccari indvielsestale for kunstnersammenslutningen Accademia di San Luca, som han havde grundlagt sammen med Girolamo Muziano og Pietro Paolo Olivieri.

Federico Zuccari døde den 20.7.1609 i Ancona, angiveligt som 69-årig.

Litteratur om Federico Zuccari:
Allgemeines Lexikon der bildenden Künstler von der Antike bis zur gegenwart. Begründet von Ulrich Thieme und Felix Becker. Leipzig, Seemann, 1907-1950.