Hvor den antikke gade fortsatte under samme navn, skifter nutidens Clivo dei Publicii udfor Kirken navn til Via di Santa Prisca. Ifølge overleveringerne skal denne kirke være indrettet i et privat hus i år 57 efter Kristus og dette hus, der tilhørte ægteparret Aquila og Priscilla og deres datter Prisca, skal allerede i år 46 have huset apostlen Peter. Sikkert er det i hvert fald, at der på dette sted har stået en kirke i slutningen af 400-tallet og at man under pladsen og Clivo dei Publicii i 1776 fandt et lille kristent kapel fra det 3.århundrede.

Flora-Templet nævnes sidste gang af kilderne i det 4.århundrede efter Kristus, hvor det blev restaureret af en Symmachus. Det er sikkert blevet ødelagt under Alarik's hærgen i Rom i år 410, hvor hele bebyggelsen på Aventin led voldsomme skader. I hvert fald lå området i Middelalderen forladt hen som enge og vinmarker, indtil Roms jødiske menighed i 1645 fik tilladelse til at købe det og anlægge gravpladsen Orto degli Ebrei.